Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms