Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms