Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim41Q5NCC3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms