Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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