Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms