Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esf1Q3V1V3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms