Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr7Q3V0I2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms