Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp48Q3V0C5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp48Q3V0C5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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