Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms