Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms