Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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