Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms