Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms