Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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