Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1203.7 ms