Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Samd12Q0VE29 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms