Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms