Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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