Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms