Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms