Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms