Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms