Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SmsP97355 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SmsP97355 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SmsP97355 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms