Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms