Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irx1P81068 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms