Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms