Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl8P62918 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms