Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3P62908 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps3P62908 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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