Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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