Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap25P60879 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap25P60879 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snap25P60879 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snap25P60879 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms