Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms