Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NcanP55066 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NcanP55066 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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NcanP55066 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NcanP55066 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NcanP55066 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NcanP55066 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NcanP55066 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcanP55066 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcanP55066 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcanP55066 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcanP55066 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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