Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb4P54761 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms