Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms