Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms