Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms