Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms