Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms