Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms