Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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