Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atxn10P28658 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms