Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hoxd10P28359 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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