Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pde6aP27664 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pde6aP27664 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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