Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd12P23812 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms