Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gja1P23242 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gja1P23242 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms