Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RarbP22605 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RarbP22605 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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