Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P20040 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
P20040 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P20040 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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