Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18529 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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P18529 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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P18529 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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P18529 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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P18529 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18529 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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P18529 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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P18529 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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P18529 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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P18529 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18529 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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