Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18526 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18526 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P18526 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms