Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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PtpraP18052 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PtpraP18052 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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